傳說(shuō)宗喀巴誕生以后，從剪臍帶滴血的地方長(zhǎng)出一株白旃(zhan)檀樹，樹上十萬(wàn)片葉子，每片上自燃顯現(xiàn)出一尊獅子吼佛像（釋迦牟尼身像的一種），“袞本”（十萬(wàn)身像）的名稱即源于此。宗喀巴去西藏6年后，其母盼兒心切，讓人捎去一束白發(fā)和一封信，要宗喀巴回家一晤。宗喀巴接信后，為學(xué)佛教而決意不返，給母親和姐姐各捎去自畫像和獅子吼佛像1幅，并寫信說(shuō)：“若能在我出生的地點(diǎn)用十萬(wàn)獅子吼佛像和菩提樹（指宗喀巴出生處的那株白旃檀樹）為胎藏修建一座佛塔，就如與我見面一樣”。第二年，即明洪武十二年（1379），香薩阿切在信徒們的支持下建塔，取名“蓮聚塔”。此后180年中，此塔雖多次改建維修，但一直未形成寺院。明嘉靖三十九年（1560），撣師仁欽宗哲堅(jiān)贊于塔側(cè)倡建靜房1座修禪。17年后的萬(wàn)歷五年（1577），復(fù)于塔之南側(cè)建造彌勒殿。至此，塔爾寺初具規(guī)模。萬(wàn)歷十年（1582）第三世達(dá)賴?yán)�嘛索南嘉措第二次�?lái)青海，翌年春，由當(dāng)?shù)厣曛邪核鲝拇肟ㄕ?qǐng)至塔爾寺。三世達(dá)賴向仁欽宗哲堅(jiān)贊及當(dāng)?shù)厣曛小⑽骷{、祁家、龍本、米納等藏族部落昂索指示擴(kuò)建塔爾寺，賜贈(zèng)供奉佛像，并進(jìn)行各種建寺儀式。從此，塔爾寺發(fā)展很快，先后建成達(dá)賴行宮、三世達(dá)賴靈塔殿、九間殿、依怙殿、釋迦殿等。經(jīng)四世達(dá)賴指示，萬(wàn)歷四十年（1612）正月，正式建立顯宗學(xué)院，講經(jīng)開法，標(biāo)志著塔爾寺成為格魯派的正規(guī)寺院。